Лучшее чего вы можете добиться - использовать любой питоновский обфускатор для усложнения понимания кода, а затем, по желанию, запаковать в бинарник через pyinstaller. От хищения самого файла никак не защититься - только если вы не будете использовать некий аппаратный ключ, выполняющий часть кода.
Нужно понимать, что у вас за устройство на другом конце eth0 - оно умеет VLANы?
Если нет, то простейшим способом будет через iptables запретить доступ подсети wlan0 к ip адресам локальной сети, кроме интернет-шлюза (плохое решение, но сработает). И не отрежте самому себе доступ к RaspberyPi :)
Попробуйте с параметром -itsoffset N
Поиграйтесь этим параметром N, пока не получите нужную синхронизацию. Например, притормозить аудио ровно на 1 секунду
