Если нужно именно включить в deb-пакет - то нужно прописать install для всех зависимостей
https://cmake.org/cmake/help/v3.11/command/install.html
Но, может, лучше прописать зависимости от определенных пакетов?..
https://cmake.org/cmake/help/v3.11/module/CPackDeb.html
CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS