Оказалось всё проще, спасибо ребятам из inpc.com.ua, помогли с подсказкой.
Для того, что б заработал второй разьем PCI на этом рейзере, надо ему отрезать INT D#(pin B8 материнки), который идет на INT A# (pin A6), и соединь его (INT A# (pin A6)) с INT C#(pin A7).
IDSEL(pin A26) этого разьема (который коммутируется перемычками на адресную линию) бросить на AD20(pin A29). Можно через 1КОм резистор.
Ещё раз отмечу, что все эти переделки относятся к ногам второго разьема, дальнего от материнки.
