Из данного описания не понятно главное: Вся почта храниться на сервере или у 1-го клиента?
1. Если почта на сервере, то многие почтовые клиенты позволяют настроить частичную загрузку по imap. Не представляю себе сценария когда все 50Гб могут требоваться одномоментно.
2. Большинство программ клиентов позволяет сделать резервную копию данных, с последующим восстановлением на другом ПК.