Есть программа
10страйк: Учёт Трафика
(
https://www.10-strike.ru/bandwidth-monitor/)
Входящий/исходящий трафик считает.
Отдельно по протоколам и ip адресам тоже может.
А по конкретным приложениям - не уверен, давно не смотрел, лучше какой-нибудь фаервол, к примеру:
Traffic Inspector (
https://www.smart-soft.ru/products/traffic-inspector/)Ashampoo FireWall (
https://www.ashampoo.com/ru/rub/sde/0050) 
