Valmih

Думаю, вам просто импорт стилей нужно сделать в файл style.sass вашего проекта. Но правки исходников фреймворка делать ТОЧНО НЕ следует, в последствии проблемы будут, да и смысл его применения теряется!

Bootstrap - это всего лишь еще один инструмент, вот и всё. Он может помочь сделать что либо быстрее и проще, но как и любой инструмент не везде может пригодится.
Если вы уже знакомы с этим фреймворком - то почему бы и не использовать? Если нет времени на изучение, делайте сами, или применяйте те инструменты с которыми уже хорошо знакомы.