Да конечно можно.
Виртуальная машина это набор файлов.
Я бы посоветовал разместить на hdd только жёсткий диск машины , а остальные файлы держать локально.
Тогда у вас только медленный старт и большие операции чтения / записи.
А такие вещи как снапшоты, сохранения состояния машины и т.п. будут выполнятся быстро.
Только помните снапшот будет хранится не на внешнем hdd в таком варианте.
Советую потому что сам использую такую схему.
У меня SSD + HDD в ноуте.