Добавляете перед таблицей
<div class="overlayTable"></div>
Вначале выполнения скрипта пишете
// JavaScript program to illustrate
// Table sort for both columns and both directions.
function sortTable(n) {
var table;
table = document.getElementById("table");
var overlayTable = document.querySelector(".overlayTable");
//добавляем эту строку
overlayTable.classList.add("working");
//...........
В конце, перед закрывающей фигурной скобкой
//.......
//удаляем класс
overlayTable.classList.remove("working");
}
Ну а сам добавленный див оформляете как нравится для
.overlayTable {
//
}
.overlayTable.working {
//
}