сделай селект всех ссылок.
document.getElementById('menu').gelElementsByTagName('a').getAtrribute('href');
таким образом у тебя будут все ссылки и при клике на одну из них, делаешь поиск . если нашел ссылку но parentElement тоесть LI добавляешь класс *active*.
Не говорю что это лучший вариант но он давольно часто встречается.
Это всё по "frontend" . Пробовал ковыряться в frontend/config/main.php ... там проде всё правильно. первый раз с таким сталкиваюсь. Это что нужно было сломать ?!