Могу посоветовать поискать программы, которые скрыто копирую данные с флешки, когда она подключается к компьютеру.
Сам когда то использовал
Usbgrab.
Работала без проблем. Можно настроить расширения файлов, которые будут копироваться в первую очередь.
Есть другие программы - поиск в Google "скрытое копирование файлов с флешки".
