iTunes работает только с тегами, его порядок файловой структуры не сильно беспокоит. Если что-то искать, так это Apple Script, который будет что-то писать в теги, сообразно структуры. Вроде бы как такое где-то было. Поищите… С просто песнями/альбомами можете разобраться по такому алгоритму:
www.imtime.ru/publication?id=9062