Сущетсвует такая вещь как
devDependencies.
И туда вы помещаете модули, которые нужны для разработки. В обычне же зависимости вы помещаете модули, которые необходимы в любом случае для работы пришложения.
А вообще, правильным подходом будет все зависимсти собирать в 1 бандл и не тащить за собой миллион модулей. Через Gulp это тоже возможно, но куда
удобнее в этом плане Webpack.