mysql_insert_id() конвертирует возвращаемый функцией MySQL C API тип значения функции mysql_insert_id() в тип long int (называемый int в PHP). Если ваша колонка AUTO_INCREMENT имеет тип BIGINT, значение, возвращаемое функцией mysql_insert_id(), будет искажено. Вместо него используйте функцию SQL LAST_INSERT_ID().