Окно появляется когда пользователь долго не был активен, а после зашевелился?
Используй запись в куки или бд.
А вот экзотический вариант прописать нужное время жизни сессии, и каждый раз выводить сообщение если сессия ранее не создавалась. Соответственно если пользователь был не активен сессию удалиться.
Так записывать только ip не верно, он может быть один и тот же у многих пользователей
