Были уже установлены на сервере php и php5. Я только обновил php, но он не используется, используется php5 для apache и cli.
в /usr/bin
из пакетов только
pecl
php5
/usr/local/bin/php-config
prefix="/usr/local"
datarootdir="/usr/local/php"
exec_prefix="${prefix}"
version="5.4.9"
vernum="50409"
include_dir="${prefix}/include/php"
/usr/bin/php-config5
prefix="/usr"
exec_prefix="${prefix}"
version="5.3.3-7+squeeze19"
vernum="50303"
include_dir="${prefix}/include/php5"
Всем спасибо. Решил!wget pecl.php.net/get/mongo-1.5.2.tgz
tar -zxvf mongo-1.5.2.tgz
cd mongo-1.5.2/
phpize5
./configure --with-php-config=/usr/bin/php-config5
make install
