Могу предложить рассмотреть плагин для Firefox под названием zotero. Позволяет бесплатно хранить библиотеку из научных статей (до 100мб, далее — за денежку) у себя. Позволяет извлекать все данные (автор/год и т.п.) из pdf автоматически. Большой плюс — интеграция ссылок на статьи с Word. Автоматическое составление списков литературы из ссылок в тексте Word, поддержание их в нужном порядке, оформление по ГОСТ. Позволяет добвлять ссылки по DOI. К сожалению, вытаскивать ссылки из статьи не умеет.