Sicness

smartliving.ru/
Главный разработчик на харбре, есть не большое сообщество. Пользовался, вполне норм.

TrueCrypt хороший вариант. Вроде его можно в DropBox использовать
EncFS хороший вариант, но, на сколько я помню, там не одним файлом.
Есть встроенные в Linux средства создания ФС в файле + его шифрования.
Для удаленной работы не плохой вариант sshfs.

Один из вариантов: красиво описать идею/предложение здесь ;)