Сергей Егоров

Ну так в примере https://docs.microsoft.com/en-us/ef/core/miscellan... , из которого вы код взяли английским же по белому написано https://docs.microsoft.com/en-us/ef/core/miscellan...

А вы тем не менее у себя именно и настраиваете два поставщика баз в контексте.

Здесь настраиваемся на использование файлового экземпляра:

protected override void OnConfiguring(DbContextOptionsBuilder optionsBuilder)
{
	optionsBuilder.UseSqlite("Filename=dbTest.db", options =>
	{
		options.MigrationsAssembly(Assembly.GetExecutingAssembly().FullName);
	});

	if (!optionsBuilder.IsConfigured)
	{
		optionsBuilder.UseSqlite("Filename=dbTest.db");
	}

	base.OnConfiguring(optionsBuilder);
}

А в тесте хотим чтобы база разворачивалась в памяти:

var connection = new SqliteConnection("DataSource=:memory:");
connection.Open();

var options = new DbContextOptionsBuilder<MyDbContext>()
	.UseSqlite(connection)
	.Options;

Исправьте метод OnConfiguring:

protected override void OnConfiguring(DbContextOptionsBuilder optionsBuilder)
{
	if (!optionsBuilder.IsConfigured)
	{
		optionsBuilder.UseSqlite("Filename=dbTest.db", options =>
		{
			options.MigrationsAssembly(Assembly.GetExecutingAssembly().FullName);
		});
	}

	base.OnConfiguring(optionsBuilder);
}