Единственный возможный вариант, пробовал все, ничего не помогло. Единственный вариант, через костыль.
1. Скачать файлы из удаленного хранилища, назвать их по-другому например добавить к файлу _temp
2. Cоздать временные объекты SharedPreference.
3. Считать все данные из скачанных префов в HashMap.
4. Из HashMap копировать все в рабочий преференс обычным способом через Editor.