RuslanUC

Вы можете изменить /static/ на что-то другое:

app = Flask(__name__, static_url_path='/js_and_css')

Так же можно сделать как вы хотите, но тогда нужно будет добавить следующий код:

from flask import send_from_directory

@app.route('/css/<filename>')
def css_folder(filename):  
    return send_from_directory('css', filename)

@app.route('/js/<filename>')
def js_folder(filename):  
    return send_from_directory('js', filename)

Тогда js и css будут браться из папок /js/ и /css/.