Михаил

в шаблоне компонента добавляем файл .parameters.php
в этот файл вставляем:

$arTemplateParameters = [
    "MENU_TITLE" => [
        "NAME" => "Заголовок"
        "TYPE" => "STRING",
    ],
];

после этого в настройках компонента появится поле "Заголовок", а в шаблоне можно достать заполненное поле через $arParams["MENU_TITLE"]

верхний уровень - это когда раздел не указан, т.е. "галка" разрешает не указывать раздел, соответственно когда добавляется в дочерний, это уже исключает логически верхний уровень

в файле .{name}.menu.php (где name - ваш тип меню) вытаскиваем все подразделы и через foreach запихиваем в массив $aMenuLinks формируя названия и ссылки
в шаблоне разбираем массив через foreach распределяя в другой массив, где ключ будет первый символ раздела
например $menu[substr($arItem["TEXT"],0,1)] = $arItem
и дальше перебираем полученный массив насаживая на него верстку
это вариант используя именно стандартный компонент menu, можно сделать свой компонент, который не будет затрагивать файлы меню а сразу будет получать разделы в свой массив распределяя по первому ключу, а дальше также перебираем полученный массив насаживая на него верстку

вариантов решения много.
1-й вариант
инфоблок с товарами - вид услуги
инфоблок с торговыми предложениями - услуга
остальное распределяем по доп свойствам и устанавливаем правила
такой вариант более приближенным к стандартным решениям, но это не верный вариант с точки программирования, т.к. слишком большая нагрузка для данного решения из-за множества ненужных запросов
2-й вариант
смотрим в битрикс как во фраймворк а не cms с готовыми решениями, используем необходимые модули и пишем свои компоненты.
те сущности которые большие и могут использовать основные поля инфоблока, а также если есть необходимость использовать функционал магазина и торгового каталога, закидываем в инфоблоки
если сущность используется для расчетов и формирования цен, не более, то закидываем в hlblock
далее средствами битрикса в компоненте пишем функционал на вытаскивание полей, расчеты и т.п. все что необходимо.
во 2м варианте необходимо иметь опыт программирования на битриксе, но это будет более правильный способ, т.к. нагрузка будет минимальная, если писать только необходимые действия, а также более гибкая для вашей фантазии.
P.S. На битриксе можно написать любой функционал, который пишется на php, главное знать что можно использовать и как это использовать. все остальное зависит от вашей логики и фантазии.

ты не праильно вчитываешься

будут добавляться в конец текущего таргета вывода скриптов.

т.е. ты выбираешь после скриптов ядра или после скриптов шаблона
если хочешь в конец страницы, то в админке в настройке главного модуля поставь соответствующую галочку

настраиваете 404-ю страницу через unit.php (вариантов в инете много)
через define("ERROR_404"), предварительно прописав условие на defined('ERROR_404') в функции в init.php, можно в любом месте перейти на 404-ю
в компоненте прописываете условие, что если результатов по акциям нету, то @define("ERROR_404")

*CATALOG_STORE_AMOUNT_<идентификатор_склада> - сортировка по количеству товара на конкретном складе (доступно с версии 15.5.5 модуля Торговый каталог).