Упаковать в архив winrar и посчитать MD5.
Нанять за его счет независимую экспертизу.
Такой инструмент можно скачать/написать и выдать "какой-то ключ", но придется доказывать, что он работает корректно и т.д.
....под сервером понимается папка с вашей работой , а не весь код сервера.
