У в документе в коллекции пользователя - массив с id записей из коллекции авто - те, автомобили. которые принадлежат пользователю.
При такой схеме может быть сложно вытянуть машины не привязанные к пользователю - что бы это упросить можно привязывать все бесхозные машины к "виртуальному пользователю".
Вообще описанная задача, ИМХО, гораздо лучше ложиться на реляционные бд.
Join в mongodb нет. Есть похожий аналог lookup, но может не подойти.
в крайнем случае надо будет join-ить в коде: получить пользователя - получить все авто пользователя - получить статистику визитов по всем авто пользователя.
Как-то так...