Сергей Петриков

Перегнать в XtraDB выставить per table, увеличить кеш, должно выполняться повеселее, но это общие советы, надо тестировать и смотреть переменные окружения и настройки сервера.

Чем распространенный продукт и чем больше установок - тем больше накоплен опыт и больше документации, так что читайте популярный=простой.

Читаем статью, ставим любое из приложений рекомендованных в статье и комментариях, узнаем что отжирает место.