Синтаксис команды T-SQL UPDATE позволяет обновлять одну таблицу, но для фильтрации по аналогии с командой SELECT можно использовать множество таблиц.
Т.е. В общем виде это выглядит так
UPDATE
ОбновляемаяТаблица
SET
ПолеОбновляемойТаблицы1 = Значение1
, ПолеОбновляемойТаблицы2 = Значение2
FROM
ОбновляемаяТаблица
LEFT OUTER JOIN
ДополнительнаяТаблица
ON
ДополнительнаяТаблица.Ключ = ОбновляемаяТаблица.Ключ
WHERE
Условия фильтрации
Для условий вашей задачи можно по этому шаблону преобразовать условия из вашего SELECT запроса в условия для UPDATE:
UPDATE
Account
SET
UsrLastActivityDate = GETDATE()
, UsrProsrochen = 1
FROM
Account account -- Основная обновляемая таблица
LEFT OUTER JOIN
Activity activity -- дополнительная таблица с информацией о задачах
ON
activity.AccountId = account.Id
WHERE
TypeId = '03a75490-53e6-df11-971b-001d60e938c6'
AND DATEDIFF(dd, ModifiedOn ,GETDATE()) > 60
AND activity.Id IS NULL -- аналогичный SELECT фильтр на отсутствие задач