Андрей Михайлов

Синтаксис команды T-SQL UPDATE позволяет обновлять одну таблицу, но для фильтрации по аналогии с командой SELECT можно использовать множество таблиц.
Т.е. В общем виде это выглядит так

UPDATE
  ОбновляемаяТаблица
SET
  ПолеОбновляемойТаблицы1 = Значение1
  , ПолеОбновляемойТаблицы2 = Значение2
FROM
  ОбновляемаяТаблица
LEFT OUTER JOIN
  ДополнительнаяТаблица
ON
  ДополнительнаяТаблица.Ключ = ОбновляемаяТаблица.Ключ
WHERE
  Условия фильтрации

Для условий вашей задачи можно по этому шаблону преобразовать условия из вашего SELECT запроса в условия для UPDATE:

UPDATE
  Account
SET
  UsrLastActivityDate = GETDATE()
  , UsrProsrochen = 1
FROM
  Account account -- Основная обновляемая таблица
LEFT OUTER JOIN
 Activity activity -- дополнительная таблица с информацией о задачах
ON
 activity.AccountId = account.Id
WHERE 
 TypeId = '03a75490-53e6-df11-971b-001d60e938c6'
  AND DATEDIFF(dd, ModifiedOn ,GETDATE()) > 60
  AND activity.Id IS NULL -- аналогичный SELECT фильтр на отсутствие задач