Я правильно понимаю, что есть две базы данных: в одной одна таблица, в другой остальные?
Даже, если я что-то не так понял, уверен, Database router поможет разобраться с тем, какая модель к какой базе относится.
https://docs.djangoproject.com/en/1.7/topics/db/mu...
Вообще, думаю, что с репликациями не в Django работать надо, а в БД. Для выборок, как выше написал, использовать роутер.