Евгений Петров

Написано же:

On the index or home page, append #disqus_thread to the end of each article URL which appears inside the href tag for the article comments link

Вот пример для первого же из топиков

<footer class="topic-footer">
	<ul class="list-unstyled list-inline small topic-info">
		<li class="topic-info-author">
			<a href="http://geekninja.ru/profile/romanstrukov/"><img src="http://geekninja.ru/uploads/images/00/00/35/2015/03/20/avatar_24x24.jpg?165946" alt="romanstrukov" class="avatar"></a>
			<a rel="author" href="http://geekninja.ru/profile/romanstrukov/">Роман Струков</a>
		</li>
		<li class="topic-info-date">
			<time datetime="2015-04-23T11:30:52+03:00" title="23 апреля 2015, 11:30" class="text-muted">
				23.04.2015
			</time>
		</li>
		<!-- Вот этот кусок для счётчика -->
		<li class="topic-info-comment">
			<a href="http://geekninja.ru/podcasts/227#disqus_thread" class="topic-comment"></a>
		</li>
	</ul>
</footer>

У вас формируется пустой блок

<div class="panel panel-default block" id="block_blogs"></div>

Или избавьтесь от генерации блока-пустышки (что правильно по сути), либо (ведь зачем-то этот id нужен?)

#block_blogs {
	border: 0;
}