MHDD как и MEMTEST проверяют диск/память в DOS режиме,
в один _линейный_ хиленький 16 разрядный поток.
А при запуске винды нагрузка на шины/память/шлейфы/цепи питания выше в несколько раз.
Так же видел подобные глюки при кривом биосе и разных планках памяти.
Ну и "вспухшие" конденсаторы в БП и на материнке.
1) Запустить винду с флешки или двд, в ней запустить AIDA64, в аиде запустить Stability Test, включив все устройства. Следить за температурой и напряжениями питания на материнке. Корпус собрать, чтобы разогрелся побыстрее. Ну и погонять так пару часов! 8)
А коли не поможет, тогда меняй по очереди бп, память, шлейфы, диск - на заведомо исправные!