Добрый день!
А urbackup у Вас от имени какого пользователя запускается?
Все файлы в /var/www/ обычно имеют пользователя/группу www-data.
Как вариант - включить пользователя, от имени которого запускается urbackup в группу www-data, либо сменить пользователя от имени которого запускается urbackup на www-data.
