Ogra

Чтобы апач мог логиниться по ssh, нужно создать ssh ключ.
Обычно он должен лежать в папке /var/www/.ssh
В общем, sudo -u apache ssh-keygen -t rsa

Возможно, стоит вынести логику обработки «запчастей» из Apache и отдать на откуп PHP скрипту. Опять же будет проще в случае чего уйти на другой сервер.