Dymok, ну как сказать - приблизительное поведение так выглядит : вы накрыли лист бумаги другим и вот .... z-index может поднять в иерархии блоков но не слоёв ... примерно у вас структура должна быть такая :
-родитель
---потомок с контентом
---потомок с контентом
---потомок с контентом
-навигация
Dymok, кнопки слайдера не должны быть в контейнере ! Вы этим самым контейнером перекрыли свой слайдер - поведение типичное - то есть правильное у z-index
transform:scale();а он работает одинаково