На самом деле 10.11 не очень дружит с 4 Гб оперативы - это прискорбно.
А так, в данном случае вам также может помочь чистая установка OS X. Мне, обладателю прошки конца 13 года, такой способ помог при переходе с 10.9 на 10.10. С 10.10 на 10.11 обновился по простому - пока все хорошо.
