NeX

1) Увеличить расстояние кластеризации, тогда для них можно использовать единый балун. Иконку кластера можно менять в зависимости от количества объектов.
2) Уменьшить сами иконки объектов.

Напишите в поддержку, с одним из доменов была аналогичная проблема