С некоторого времени в Вебмастере стали появляться ссылки, например /?_ym_debug=2 или /?gtm_debug=1729657003761.
Подскажите, пожалуйста, где мне найти источник проблемы?
Проверка цели. У Вас не запрещена индексация страниц с не нужными url параметрами. По идее, поисковик воспринимает такие страницы, как дубли.
Пример запрета индексации любых url с url параметрами без слэша на конце (robots.txt):
User-agent: *
Disallow: *?
Со слэшем:
User-agent: *
Disallow: */?
Правило размещать в начале файла, затем, его ниже можно перекрыть, написав новое Allow правило, это необходимо для разрешения индексации страниц с определенными url параметрами.