MechanicZelenyy

В самом общем случае никак. Если разработчики не блюдут договоренности и программа сорит где попало, то придется ручками подчищать. А так посмотрите файлы программы в .config и .local

Создаете отдельный ключ на каждый аккаунт, потом их всех скопом добавляете в ssh агент, он сам разберется какой куда использовать.

Если вы один работаете за компьютером, иммет смысл ставить не в системные разделы, а в вашей домашней директории.

Если у вас получается зайти в консоль, то попробуйте сделать что-нибудь оттуда: установить другое DE, сменить DM, или вручную запустит X сервер.

Если проект на c++, то лучше все-таки использовать cmake, и настраивать параметры установки в нем. А он уже нужный makefile сгенерирует.

Не надо. Это не Виндовс и поэтому желательно почитать какие-нибудь статьи по этой теме.

Свободное место можете посмотреть командой df -h или через графическую утилиту.