Погуглил немного. Похоже, хрому не нравиться то, что в архиве находиться экзешник. Т.е. получается, что он отбраковывает все архивы, внутри которых находится исполняемый файл, считая их опасными.
Решения как-такового нигде нету. Рекомендуют только добавить сайт в Google Webmaster tool и подождать когда гугл просканирует файл и убедится, что он не вредоносный…
Ещё нашел про какое-то решение связанное с Content-type:
tinyurl.com/cs6vnmh
А здесь:
tinyurl.com/cclu2o6 рекомендуют подредактировать .htaccess.