На счет сотен гигобайт не скажу, но с базой около 30Г у MySQL никаких проблем нету. Да и на сотнях гигобайт быть не должно.
Насколько быстро будет работать на больших объемах данных в таблице зависит от индексирования полей. Здесь универсального рецепта нету, надо находить золотую середину и ориентироваться на то, что важнее для конкретной таблицы быстрая вставка или быстрое чтение. Если в таблицу большую часть времени данные только пишутся, а запросы по ней выполняются редко, то индексы надо свести к минимуму. Если индексов в таблице кроме первичного ключа нету то на скорость вставки ее размер влиять не будет.
Рекомендую глянуть пару советов по оптимизации работы с MySQL
https://habr.com/ru/post/20246/ 
