Я слышал про способ запрета выполнения запускаемых файлов с флешки. Ну а на компьютере максимально урезать права. Для Ntfs папок там тоже есть параметр безопасности «Запуск файлов», который можно убрать, это если нужна папка в которую скидывать работы (http://www.sysadmins.lv/content/binary/WindowsLiveWriter/2SoftwareRestrictionPolicies_FCC0/TempACL_thumb.jpg второй параметр).