Иван Корюков

Вы в цикле перезаписываете 2 элемента одного массива, а надо добавлять массив с двумя элементами:

foreach ($serId as $catS) {
    if($catS->id_serial) {
        $idSer[]=[
            'id'=>$catS->id_serial,
            'nesting'=>'serial'
        ];
    }
}

Реализовать можно, однако PHP не очень подходит для организации чатов и подобных вещей, где сервер должен держать соединение с множеством клиентов и инициировать отправку данных.
Лучше посмотреть в сторону NodeJS, go, Java, Python...

В основе всех высокоуровневых протоколов взаимодействия компьютеров по сети лежит socket соединение. Когда ты работаешь в браузере, ты не можешь его использовать, у тебя есть только http (ajax это тоже http), грязные хаки, вроде long polling, ну и модный нынче WebSocket.

Если клиент пишется на C, да и вообще на чём угодно что поддерживает сокеты, то тут даже гадать нечего. PHP имеет расширение для работы с сокетами. Раньше вроде считалось что оно не очень, и работают с ним одни извращенцы. Оно и понятно - PHP заточен под http.

На самом деле необходимо придумать или реализовать уже известный, или даже взять библиотеку, в которой уже запрограммирован протокол общения между клиентом и сервером.
По сути, так же как http с его заголовками и телом запроса является протоколом над TCP, то и вам необходимо придумать/ взять готовый протокол такого же уровня - над TCP.

Скорее всего точка входа в обработчик лежит в папке /content/topic/add, и он кладёт файл в папку uploads/. Тогда эти два пути складываются в /content/topic/add/uploads/.
Надо указывать путь относительно корня сайта, например вот так:
$_SERVER['DOCUMENT_ROOT'].'/uploads/'

Инъекция зависимостей, это когда ты не жёстко в коде прописываешь то что один компонент использует другой, а передаёшь один компонент другому.
Конкретно:

// без DI
class Application{
     private $database;
     public function start(){
          $this->database=new Database("localhost","user","pass");
          //....
     }
}
$application = new Application();
$application->start(); 

// с DI
class Application{
     private $database;
     public fucnction __construct(Database $d){
           $this->database=$d;
     }
     public function start(){
          //....
     }
}
$application = new Application(new Database("localhost","user","pass"););
$application->start()

Таким образом создание большинства компонентов сосредотачивается в одном месте - там где запускается приложение.
Зачем?
Во первых удобно контролировать. Если мы захотим использовать вместо Database другой класс для работы с БД, мы знаем где и что поменять.
Во вторых удобно тестировать, это вытекает из первого - для юнит тестирования нам наверняка понадобится вместо Database использовать Mock объект. Ну и лёгкость замены компонента нам только на руку.