В данном случае только настройкой на роутере
сделать это не выйдет. Нужно будет настраивать на клиентах и на самом роутере.
Например теоритически можно маркировать трафик определенных приложений на клиентах и далее
применять к данному траффику разрешающие правила на роутере.
Можно например использовать для работы приложения прокси на самом роутере доступ с которого не ограничивается. Тогда на клиентах нужно настраивать работу приложения через прокси.