Kerm

В одну строчку нельзя?

"set @i := -1;update tablename set id = (@i := @i+1 ) order by id;"

Так 3. обновление всех записей при UPDATE `test` SET `updated` = 0 происходит в транзакции и не чего не блокирует или Вы имеете ввиду что по времени выполнения обновления увеличивает продолжительность отработки запроса?