Илья Т.

Если вы делаете полный блочный бэкап диска, то уменьшение размера диска, очевидно увеличит скорость бэкапа.
Какой конкретно тип бэкапа вы используете - вопрос к вам и вашему акронису.
Другой вопрос: если вы используете ZFS то почему бы вам не использовать снапшоты? Для вашей конкретно задачи они подходят идеально.

Я конечно всего не знаю, но на первый взгляд непонятно - зачем вам создавать искусственное узкое место и точку отказа в виде сервера на хостинге. поднимите по два туннеля с каждого офиса и будет вам счастье. Тем более поднимать фрю на vps - неочевидное решение.

Btsync?