Скорее всего где-то в BIOS (uefi) включена опция FastBoot (может называться иначе, но смысл тот же). При изменении настроек загрузка происходит немного иначе- потому и можно загрузится с HDD. А вот после штатного выключения- грузится в режиме FAST, где инициализация происходит немного иначе, это как-то связано именно с UEFI, деталей я , увы, не знаю, но почему-то SSD (точнее- UEFI-загрузчик (он вроде как даже не на самом SSD, а непосредственно в BIOS лежит (я могу ошибаться)) всегда идет первым, независимо от порядка прописанного в разделе BOOT БИОСа
