Странно. А в чем заключается опасность такого подключения?
На самом деле есть три варианта подключения:
- Захардкодить абсолютный путь
- Использовать относительный путь, как у вас
- Использовать абсолютно/относительный путь, но с функцией
include( dirname( __FILE__ ) . '/../include/core.php' );
Первый вариант вообще непотребен. Вариантов остается не много.