В общем я задал вопрос тех. поддержке яндекса:
Здравствуйте. Виджет переводчика, ведет на документацию в которой вообще о виджете не слова. В частности, как для виджета выбрать для перевода не весь список из 80 языков, а например 5, которые необходимы. И как используя виджет запретить переводить определенные слова в html разметке. Например гугл виджет для этого использует класс notranslate и все что в нем не будет переведено.
И получил ответ:
Здравствуйте, Виталий!
Такой возможности в нашем виджете сейчас нет.
Спасибо за желание сделать Яндекс.Переводчик удобнее! Я передал ваше предложение команде разработки.
Пришлось выкручиваться самому, я создал разметку со списком языков и через js сделал выбор тех языков, которые мне нужны имитируя клики по спрятаному виджету. Как появиться время распишу где-нибудь более подробно.
UP. Написал скрипт
https://github.com/get-web/yandex-translate-custom... 
