Есть очень простое правило - правильно так, как проще.
Можете вовсе использовать master для синхронизации всех файлов, ничего страшного если идет активная стадия разработки, Вы единственный разработчик, а релиз еще очень нескоро. И если умеете не перескакивать от одной недоделанной задачи к другой.
Как только понадобится делать релизы, там уже можно заморочиться с master, staging, feature-бранчами и тп, но только по мере необходимости.
PS. Раз уж мы действуем по принципу KISS, вместо утилиты командной строки лучше использовать удобный GUI, например на Mac это Source Tree (по-моему самая классная программа на моем ноуте).
Это также поможет работать с гитом правильнее - вручную просматривать и стейджить каждый измененный файл, а не через git add -A.