Всячески рекомендую MongoDB через mongoose — в настоящее время наиболее качественно развитая связка для ноды
+ во многих проектах уже стандарт де факто
+ простой понятный лаконичный и мощный инструментарий
+ жрёт мало ресурсов (как и всё для ноды, как и сама нода =)) )
+ документации достаточно
…
PS:
mongoosejs.com/ 
