Как решить задачу?

ну так попробуйте убрать select
ну и в целом посмотрите примеры с datediff

Как решить задачу?

Непонятно, почему новичок работает с clickhouse
но в целом просто в любом запросе, где нужно получить статус, просто пишется
if(DATEDIFF(day,(select created_at from test),(select now()))>2,'yes','no')
если это рабочий код.
Если нет, то надо посмотреть правильный синтаксис

Как правильно спроектировать БД?

а в чем смысл таблицы dialogs?

в любом случае в таблицу message_files колонку dialog_id добавлять бессмысленно, поскольку все файлы диалога тупо находятся через джойн.

Слетает кодировка в меню при очистке кэша сайта?

Заголовки правильные.
Черный ромб означает, что браузер ждёт данные в утф 8, а ему приходит однобитная кодировка.
Вы или получаете данные из бд криво, или портите их по дороге

Слетает кодировка в меню при очистке кэша сайта?

"Мета теги" вообще ничего не значат. Кодировкой управляют НТТР заголовки

Слетает кодировка в меню при очистке кэша сайта?

MySQL не знает про такую кодировку.
Давайте вы соберётесь с мыслями, и приведете в вопросе конкретный код

Слетает кодировка в меню при очистке кэша сайта?

Какую именно кодировку вы "пробовали", мы, конечно-же, должны догадаться сами? ;)

Может кто-нибудь дать реальную задачу на которой можно применить ООП?

Вот кстати сейчас прямо в яблочко!

Может кто-нибудь дать реальную задачу на которой можно применить ООП?

Это только одно из достоинств ООП - инкапсуляция.
Другие тоже добавляют удобства, например наследование. Можно написать код один раз, и потом использовать его в куче мест.

Может кто-нибудь дать реальную задачу на которой можно применить ООП?

Только дураки требуют от джунов паттернов проектирования. К таким и не нужно наниматься.
Расти работая прекрасно получается - важно анализировать свои действия, а не тупо обезьянить код.

Call to undefined function checkFields(), как исправить?

На всякий случай, вот код для update и delete

public function update(array $data, int $id): void
    {
        $this->checkFields($data);

        $params = [];
        $set = "";
        foreach($data as $key => $value)
        {
            $set .= ($set ? "," : "") . "`$key` = ?";
            $params[] = $value;
        }
        $params[] = $id;
        $sql = "UPDATE `$this->table` SET $set WHERE `$this->primary`=?";
        $this->db->prepare($sql)->execute($params);
    }
    public function delete($id)
    {
        $sql = "DELETE FROM `$this->table` WHERE `$this->primary`=?";
        $this->db->prepare($sql)->execute([$id]);
    }

Call to undefined function checkFields(), как исправить?

в РНP нет такой функции.
вы ее видели в чьем-то коде. вот там и надо её искать
Хотя судя по её виду, пожалуй и не стоило бы. Все равно ничего умного она неделает

Как устранить Undefined array key после назначения переменных через explode()?

Вы раскопали 5% от моих ответов, и с плохо скрываемым сарказмом назвали их "конкретными". Скромно умолчав про остальные.
Вы даже не вспомнили, как я буквально за уши вас тащу к свету, и трачу кучу времени, чтобы пробиться через ваше детсадовское самомнение и зазнайство, каждый раз объясняя элементарные вещи.
Вы совершенно забыли про свои собственные тирады на тему "меня никто не понимает, моя ситуация уникальная!!!".
Вы не вспомнили то бешеное сопротивление, которое оказываете любой попытке что-то вам объяснить.
Вы вдруг резко забыли причину, по которой я и написал свою последнюю реплику. Которая была вызвана вашим очередным отказом делать по-человечески.
Вы внезапно вообще не обращаете внимания на СВОЮ манеру общения, когда вместо "ну хорошо, допустим такой вариант, но у меня вот такая ситуация" вы сходу выдаете свое фирменное "МНЕ ЭТО НЕ ПОДОЙДЕТ!!!". Чтобы потом, после траты кучи времени и нервов, все-таки согласиться.

При таком подходе-то конечно, вы у нас будете беленький и пушистенький, без единого пятнышка. А вокруг одни негодяи с завышенным ЧСВ :)

Как устранить Undefined array key после назначения переменных через explode()?

При случае посмотритесь в зеркало.

Как устранить Undefined array key после назначения переменных через explode()?

Вы такой забавный :)
Просмотрели кучу моих ответов,и пришли сказать мне, что это оказывается я на вас подписался. Хотя, внезапно, такого функционала на этом сайте нету :)

Как устранить Undefined array key после назначения переменных через explode()?

Пишите. Пишите как придумали.
Я ОЧЕНЬ надеюсь, что вам этот код придется в дальнейшем поддерживать и модернизировать.
И это будет меня очень, очень радовать )

Как устранить Undefined array key после назначения переменных через explode()?

Тем более тогда надо завести эталонный массив и один раз заполнить его данными, полученными из файла.
И потом спокойно обращаться к его элементам без костылей.
Это если делать по уму.

А если делать чтобы доказать всем, что они круглые идиоты, не понимающие ваших уникальных проблем - то конечно надо по всему коду распихивать костыли с проверками на каждый чих.

Как устранить Undefined array key после назначения переменных через explode()?

я уже писал, что предлагаю
Это написано в ответе, который вы комментируете

Как реализовать поиск по файлу?

Вооооот! Я же говорил!

Функции хелперы, что это и зачем они нужны если и без них всё работает?

Классы к функциям отношения не имеют, это отдельный элемент языка