В обоих случаях приоритет стилей бутстрапа выше чем у ваших стилей.
В первом случае у класса bg-light на белом цвете стоит !important, значит это так просто не обойти и необходимо указывать !important в своих кастомных стилях навбара, либо убрать класс bg-light с элемента.
Во втором случае высокий приоритет селектора обусловлен указанием 3 классов (.navbar-light .navbar-nav .nav-link), это означает, что в кастомных стилях придется указать такое же количество классов, для повышения приоритета (наприм. .navbar-light .navbar-nav .section__header-nav-link)